El Proyecto Multidisciplinario del Colegio Columbia es, sin duda, uno de los mayores aciertos académicos realizados por la institución en los últimos años; es más, no sólo trasciende las fronteras intrínsecas entre materias sino también entre todos los grados del Colegio. Desde kinder 1 hasta sexto de bachillerato los alumnos están involucrados en la realización de un proyecto de investigación científico de alcance universitario.
Por un lado, el proyecto permite integrar el conocimiento de las múltiples disciplinas científicas en un fenómeno que trasciende la esfera social e impacta en términos económicos, políticos, ideológicos y ambientales en nuestro entorno. Por otro lado, fomenta el trabajo colaborativo y asienta los fundamentos de la metodología de investigación.